Són les dues malalties més temibles i  afecten a l'arrel de la noguera. Produïdes per dos fongs, la primera ataca les arrels de l'arbre i la segona, principalment el coll de l'arrel.

No tots els portaempelts són igualment sensibles. Actualment s'estan experimentant portaempelts més resistents. En principi, J. Nigra és més resistent a Phytophtora i J. Regia és més sensible. (veure "porta-empelts de la noguera"). Un porta-empelt de gran resistència és Pterocaryastenoptera, actualment en estudi, que presenta poca afinitat amb algunes varietats de noguera. En el futur, segurament la disponibilitat de nous portaempelts, possibilitarà la plantació de nogueres en sòls en els que actualment no és aconsellable, per la seva excessiva humitat o per haver tingut plantacions anteriorment. Aquest problema limita l'ús de plantes procedents de multiplicació "in-vitro" que, per ser J.Regia sobre les seves pròpies arrels, són molt sensibles.