En aquest aprtat es descriuen les principals malalties del noguer: 

• Bacteriosis del nogal (Xanthonomas campestris p.v.juglandis)
• Antracnosis (gnomia leptostyla)
• Armillaria y Phytophtora  (Armillaria mellea y Phytophtora, esp.)
• Deepbark canker (Erwinia rubefaciens)
• Necrosis apical
• Mosca de la nuez (Rhagoletis completa)
• Carpocapsa (Laspeyresia pomonella
• Polilla del nogal (amyelois transitella y ectomyelois ceratoniae)